illumina IP-202-1012 文庫制備試劑盒A

產(chǎn)品名稱：illumina Truseq Chlp Library PreparationKit文庫制備試劑盒TruSeq ChlP Library Preparation Kit-Set A

產(chǎn)品貨號：IP-202-1012

產(chǎn)品說明：

測定時間 從芯片DNA到1.5天

輸入量 5 ng芯片dna

系統(tǒng)兼容性 HiSeq 1000，HiSeq 1500，HiSeq 2000HiSeq 2500, HiSeq 3000, HiSeq 4000, 米塞克, 研究模式下的MiSeqDx, NextSeq 500, NextSeq 550

特殊樣本類型 低輸入樣本

物種類別 酵母，老鼠，果蠅，人，斑馬魚，細(xì)菌，線蟲，任何物種，老鼠，植物

技術(shù) 測序

方法 切克

核酸型 脫氧核糖核酸

產(chǎn)品介紹：

illumina Truseq Chlp Library PreparationKit文庫制備試劑盒用于Chlp來源DNA的染色質(zhì)免疫沉淀測序文庫制備。大約1.5天完成5ng DNA文庫的制備。TruSeq芯片Libary準(zhǔn)備試劑盒為從芯片衍生DNA生成染色質(zhì)免疫沉淀測序(芯片-Seq)庫提供了一種簡單、成本效益高的解決方案。芯片-seq利用下一代測序(NGS)快速而有效地確定基因組中所關(guān)注的dna結(jié)合蛋白的分布和豐度。這種方法已成為zui廣泛應(yīng)用的NGS應(yīng)用之一，使研究人員能夠可靠地同時識別整個基因組中廣泛目標(biāo)的結(jié)合位點(diǎn)，具有高分辨率和無約束。

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illumina  IP-202-1012  illumina Truseq Chlp Library PreparationKit文庫制備試劑盒TruSeq ChlP Library Preparation Kit-Set A

illumina  IP-202-1024  illumina Truseq Chlp Library PreparationKit文庫制備試劑盒TruSeq ChlP Library Preparation Kit-Set B

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Illumina二代測序技術(shù)，邊合成邊測序（SBS），是廣泛采用的新一代測序（NGS）技術(shù)，負(fù)責(zé)產(chǎn)生世界上90％以上的測序數(shù)據(jù)。
Illumina的二代測序技術(shù)稱為邊合成邊測序(Sequencing-by-Synthesis,簡稱SBS)。SBS主要包括堿基延伸、熒光激發(fā)及信號收集、剪切等3個步驟。這3個步驟可以重復(fù)，循環(huán)進(jìn)行。每循環(huán)一次測定一個堿基。想測定多少個堿基（即讀長），就循環(huán)多少次。測序循環(huán)次數(shù)可以在軟件里設(shè)定。到底測序多長合適，要根據(jù)項目性質(zhì)和需求來決定。大多數(shù)情況下，SR實驗（單端測序）測定1x50個堿基，PE實驗（雙端測序）測定2x150個堿基。
1 堿基延伸
Illumina測序試劑里所使用的dNTP極ju特色，它們同時具有兩個修飾基團(tuán)：一個熒光基團(tuán)，一個可逆終止基團(tuán)。A、G、C、T 4種堿基分別標(biāo)記4種不同的熒光基團(tuán)，它們在不同波長的激光激發(fā)下，能夠發(fā)射不同波長（即顏色）的熒光。熒光顏色與堿基種類一一對應(yīng)，因此根據(jù)激發(fā)光的波長可以識別堿基。4種堿基的終止基團(tuán)是一樣的。由于終止基團(tuán)的存在，所有dNTP每次都只能延伸1個堿基，無論給予多長的反應(yīng)時間。又由于該終止基團(tuán)是可逆的，在熒光信號收集完畢之后，可以用剪切劑切除該終止基團(tuán)，使堿基恢復(fù)自然的可延伸狀態(tài)，這時即可繼續(xù)進(jìn)行下一輪循環(huán)，再測定一個堿基。
可逆終止基團(tuán)技術(shù)是Illumina二代測序的一大特色。它與橋式PCR技術(shù)一起，構(gòu)成了Illumina二代測序的兩大支柱，為穩(wěn)定獲得高質(zhì)量的測序數(shù)據(jù)打下了堅實的基礎(chǔ)。
2 信號采集
HiSeq系列測序儀具有紅綠兩根激光管，兩個濾色片。它們兩兩組合，可以形成4種不同的激發(fā)波長，正好分別用于激發(fā)A、G、C、T 4種堿基。
Cluster上所標(biāo)記的熒光基團(tuán)在激光激發(fā)下產(chǎn)生的信號，可以用相機(jī)拍攝或者掃描的方式收集信號。掃描技術(shù)速度比較快，被X10系列采用。由于FC面積比較大，而且上表面和下表面要分別拍照，所以拍照過程相當(dāng)耗時。對于經(jīng)典的HiSeq 2000來說，一次測序循環(huán)所產(chǎn)生的熒光信號，需要大約40分鐘的時間才能拍照收集完畢，時間比測序反應(yīng)本身還要長。
3 剪切
熒光信號收集完畢后，關(guān)閉激光，用剪切劑去除測序引物的延伸產(chǎn)物上的堿基所標(biāo)記的熒光基團(tuán)和終止基團(tuán)。兩個修飾基團(tuán)均被切除，一方面消去干擾熒光，一方面使鏈末端的堿基回復(fù)到自然的可延伸狀態(tài)，為下一輪測序做好準(zhǔn)備。
再重復(fù)合成、激發(fā)、收集等步驟，即可進(jìn)行第二個堿基的測序。

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